Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IFT88Q13099 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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