Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMARCB1Q12824 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMARCB1Q12824 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMARCB1Q12824 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMARCB1Q12824 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMARCB1Q12824 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SMARCB1Q12824 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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