Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
AP3M2P53677 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
AP3M2P53677 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
AP3M2P53677 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
AP3M2P53677 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
AP3M2P53677 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
AP3M2P53677 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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