Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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TMOD1P28289 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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TMOD1P28289 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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TMOD1P28289 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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TMOD1P28289 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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TMOD1P28289 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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TMOD1P28289 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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TMOD1P28289 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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TMOD1P28289 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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TMOD1P28289 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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TMOD1P28289 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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