Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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CLDN4O14493 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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CLDN4O14493 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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CLDN4O14493 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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