Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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GDE1Q9NZC3 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GDE1Q9NZC3 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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