Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDO1Q16878 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDO1Q16878 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDO1Q16878 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDO1Q16878 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDO1Q16878 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDO1Q16878 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDO1Q16878 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDO1Q16878 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDO1Q16878 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDO1Q16878 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.7 ms