Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PDK4Q16654 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PDK4Q16654 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms