Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SSX1Q16384 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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SSX1Q16384 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
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SSX1Q16384 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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SSX1Q16384 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
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SSX1Q16384 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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SSX1Q16384 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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SSX1Q16384 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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SSX1Q16384 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SSX1Q16384 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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