Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ALX1Q15699 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.42□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
ALX1Q15699 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
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