Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SS18Q15532 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SS18Q15532 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SS18Q15532 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SS18Q15532 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SS18Q15532 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms