Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SHHQ15465 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SHHQ15465 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SHHQ15465 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHHQ15465 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHHQ15465 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHHQ15465 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHHQ15465 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHHQ15465 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHHQ15465 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHHQ15465 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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