Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAM2Q15035 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms