Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ALCAMQ13740 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ALCAMQ13740 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms