Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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CACNA1SQ13698 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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CACNA1SQ13698 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1SQ13698 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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