Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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SKP2Q13309 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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SKP2Q13309 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SKP2Q13309 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SKP2Q13309 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SKP2Q13309 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SKP2Q13309 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SKP2Q13309 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SKP2Q13309 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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