Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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TRAF1Q13077 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TRAF1Q13077 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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