Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD13P35453 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD13P35453 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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