Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TSPOP30536 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TSPOP30536 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TSPOP30536 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TSPOP30536 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TSPOP30536 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TSPOP30536 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TSPOP30536 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TSPOP30536 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TSPOP30536 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TSPOP30536 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TSPOP30536 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TSPOP30536 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TSPOP30536 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TSPOP30536 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TSPOP30536 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TSPOP30536 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TSPOP30536 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TSPOP30536 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TSPOP30536 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TSPOP30536 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
TSPOP30536 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TSPOP30536 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TSPOP30536 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TSPOP30536 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TSPOP30536 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TSPOP30536 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TSPOP30536 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TSPOP30536 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TSPOP30536 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TSPOP30536 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TSPOP30536 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TSPOP30536 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TSPOP30536 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TSPOP30536 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TSPOP30536 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TSPOP30536 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TSPOP30536 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TSPOP30536 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TSPOP30536 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TSPOP30536 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TSPOP30536 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TSPOP30536 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TSPOP30536 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TSPOP30536 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TSPOP30536 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TSPOP30536 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TSPOP30536 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TSPOP30536 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms