Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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TMOD1P28289 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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TMOD1P28289 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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TMOD1P28289 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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TMOD1P28289 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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TMOD1P28289 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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TMOD1P28289 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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TMOD1P28289 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
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TMOD1P28289 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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TMOD1P28289 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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TMOD1P28289 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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TMOD1P28289 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMOD1P28289 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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