Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TSPAN13O95857 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TSPAN13O95857 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms