Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLDN4O14493 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLDN4O14493 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLDN4O14493 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CLDN4O14493 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLDN4O14493 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLDN4O14493 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLDN4O14493 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CLDN4O14493 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CLDN4O14493 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLDN4O14493 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLDN4O14493 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLDN4O14493 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLDN4O14493 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLDN4O14493 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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CLDN4O14493 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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CLDN4O14493 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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CLDN4O14493 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN4O14493 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN4O14493 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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