Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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