Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CNTN3Q9P232 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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CNTN3Q9P232 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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CNTN3Q9P232 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNTN3Q9P232 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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