Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
EHD3Q9NZN3 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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