Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDGFDQ9GZP0 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PDGFDQ9GZP0 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms