Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZBED3Q96IU2 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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ZBED3Q96IU2 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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ZBED3Q96IU2 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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ZBED3Q96IU2 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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ZBED3Q96IU2 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
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ZBED3Q96IU2 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZBED3Q96IU2 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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