Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NEURL3Q96EH8 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEURL3Q96EH8 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.3 ms