Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE3

SEH1L, Nucleoporin SEH1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1LQ96EE3 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SEH1LQ96EE3 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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