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| UPP1 | Q16831 | MIR802-201 | ENST00000390235 | 94 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | TRAJ47-201 | ENST00000390490 | 57 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORD72-201 | ENST00000390994 | 80 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | HMGN2P32-201 | ENST00000444648 | 269 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-322P-201 | ENST00000516010 | 103 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | RN7SKP88-201 | ENST00000516847 | 250 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-165P-201 | ENST00000517170 | 99 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | AP003715.1-201 | ENST00000532109 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC019288.1-201 | ENST00000557918 | 224 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL078603.1-201 | ENST00000603824 | 313 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
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| UPP1 | Q16831 | EYS-205 | ENST00000393380 | 5450 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | NPAT-201 | ENST00000278612 | 6117 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AL603910.2-201 | ENST00000407268 | 136 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
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| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.590-201 | ENST00000410140 | 107 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC090142.3-201 | ENST00000519012 | 385 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC008507.4-201 | ENST00000585464 | 127 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | GHRLOS.1-201 | ENST00000610995 | 70 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF518A-210 | ENST00000624776 | 7994 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-574P-201 | ENST00000384265 | 107 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.572-201 | ENST00000384757 | 98 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORD127-201 | ENST00000458892 | 86 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | RN7SKP179-201 | ENST00000516126 | 217 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.679-201 | ENST00000516416 | 91 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC087362.2-201 | ENST00000529325 | 256 nt | TSL 3 BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC087685.1-201 | ENST00000587507 | 141 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC006006.1-201 | ENST00000603082 | 144 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL049861.1-201 | ENST00000603130 | 150 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.802-201 | ENST00000614892 | 130 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.277-201 | ENST00000364754 | 102 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.352-201 | ENST00000365439 | 102 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-442P-201 | ENST00000383968 | 104 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORD2.1-201 | ENST00000458762 | 69 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPS23P4-201 | ENST00000487908 | 423 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC02277-202 | ENST00000556472 | 453 nt | TSL 3 BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR4643-201 | ENST00000577473 | 78 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL021707.8-201 | ENST00000609428 | 183 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF415-224 | ENST00000601493 | 2132 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.24-201 | ENST00000362508 | 103 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.82-201 | ENST00000363000 | 102 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.92-201 | ENST00000363043 | 102 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.235-201 | ENST00000364412 | 102 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU4-38P-201 | ENST00000364472 | 129 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA25.8-201 | ENST00000364831 | 128 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.306-201 | ENST00000365015 | 102 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.312-201 | ENST00000365089 | 102 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.322-201 | ENST00000365151 | 102 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.477-201 | ENST00000384352 | 108 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA8.3-201 | ENST00000384679 | 139 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR520E-201 | ENST00000384867 | 87 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR136-201 | ENST00000385207 | 82 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.650-201 | ENST00000459002 | 102 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1132P-201 | ENST00000459214 | 107 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.668-201 | ENST00000516233 | 93 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA18.7-201 | ENST00000516910 | 131 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.777-201 | ENST00000516982 | 102 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC100767.1-201 | ENST00000528178 | 123 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA4-201 | ENST00000584302 | 138 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.771-201 | ENST00000598668 | 102 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.789-201 | ENST00000622480 | 102 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORD27-201 | ENST00000363981 | 72 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-196P-201 | ENST00000384315 | 107 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.556-201 | ENST00000384677 | 113 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR489-201 | ENST00000384923 | 84 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR526A2-201 | ENST00000390198 | 65 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR1285-1-201 | ENST00000408593 | 84 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNRPGP14-201 | ENST00000435400 | 219 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC023449.1-201 | ENST00000454464 | 154 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL583859.1-201 | ENST00000455871 | 335 nt | TSL 3 BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC245047.8-201 | ENST00000456455 | 284 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP220-201 | ENST00000516298 | 104 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-113P-201 | ENST00000516653 | 101 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU7-149P-201 | ENST00000516739 | 59 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | TTC28-AS1_2.1-201 | ENST00000611117 | 157 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | uc_338.4-201 | ENST00000616635 | 176 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR6734-201 | ENST00000621166 | 68 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP327-201 | ENST00000362494 | 101 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-268P-201 | ENST00000364174 | 107 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-42P-201 | ENST00000384165 | 107 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORD38C-201 | ENST00000384381 | 69 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-939P-201 | ENST00000384634 | 107 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP496-201 | ENST00000391240 | 109 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR548H3-201 | ENST00000408771 | 118 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL365434.1-201 | ENST00000412362 | 380 nt | TSL 3 BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL136320.1-201 | ENST00000417273 | 430 nt | TSL 3 BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC068658.1-201 | ENST00000507509 | 388 nt | TSL 2 BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORD116-28-201 | ENST00000516123 | 91 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |