Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CDKN3Q16667 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CDKN3Q16667 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDKN3Q16667 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDKN3Q16667 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CDKN3Q16667 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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