Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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