Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSRP2Q16527 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CSRP2Q16527 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CSRP2Q16527 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CSRP2Q16527 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSRP2Q16527 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CSRP2Q16527 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms