Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TNXAQ16473 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TNXAQ16473 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.7 ms