Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NEDD8Q15843 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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