Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ZNHIT3Q15649 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZNHIT3Q15649 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms