Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PDCD1Q15116 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PDCD1Q15116 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PDCD1Q15116 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
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PDCD1Q15116 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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PDCD1Q15116 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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PDCD1Q15116 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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PDCD1Q15116 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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PDCD1Q15116 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PDCD1Q15116 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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