Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRAM2Q15035 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms