Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD1Q15011 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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