Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
GBX1Q14549 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GBX1Q14549 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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