Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SCN5AQ14524 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
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