Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CUL1Q13616 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CUL1Q13616 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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