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Protein–RNA interactions for Protein: Q13616
CUL1, Cullin-1, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL1
Q13616
Y_RNA.445-201
ENST00000384168
102 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
SNORD115-46-201
ENST00000390982
71 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
AL035258.1-201
ENST00000439450
439 nt
TSL 3
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
HSPE1P25-201
ENST00000455484
251 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNU6-496P-201
ENST00000516145
99 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
Y_RNA.676-201
ENST00000516393
96 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNA5SP121-201
ENST00000516537
101 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
Y_RNA.715-201
ENST00000517082
110 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
MIR4795-201
ENST00000584182
89 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
AC022140.2-201
ENST00000623500
188 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNU6-396P-201
ENST00000365369
105 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
SNORA51.10-201
ENST00000384418
136 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
SNORD99-201
ENST00000408612
74 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
MIR1278-201
ENST00000408753
81 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
AJ239322.2-201
ENST00000421696
575 nt
TSL 5
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
AC005534.2-201
ENST00000431047
433 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
AC092783.1-201
ENST00000435832
231 nt
TSL 3
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
AL157398.1-201
ENST00000452981
186 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNU6-1170P-201
ENST00000515974
106 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNU6-764P-201
ENST00000516396
105 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNU4-54P-201
ENST00000516428
129 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
MIR151B-201
ENST00000584249
96 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
AL078603.1-201
ENST00000603824
313 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
MIR4791-201
ENST00000607666
84 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
SAMD9-203
ENST00000620985
6754 nt
APPRIS P1
TSL 2
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
SNORD113-8-201
ENST00000363497
74 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNA5SP499-201
ENST00000363982
119 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNU6-1138P-201
ENST00000365359
106 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
Y_RNA.376-201
ENST00000365638
108 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
Y_RNA.431-201
ENST00000384086
102 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
Y_RNA.645-201
ENST00000391229
102 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNU6ATAC33P-201
ENST00000408647
126 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNU6-847P-201
ENST00000411115
108 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
AC244098.3-201
ENST00000424803
96 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
SCARNA8-201
ENST00000515924
131 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNU6-1046P-201
ENST00000516538
107 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
MIR548AO-201
ENST00000579992
96 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
MIR376A1-201
ENST00000616574
68 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
AC090574.1-201
ENST00000623186
233 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
MTND1P7-201
ENST00000632801
297 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNU6-369P-201
ENST00000362515
102 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNU4-90P-201
ENST00000362773
141 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNU6-763P-201
ENST00000390865
106 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
Y_RNA.581-201
ENST00000391017
97 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNA5SP496-201
ENST00000391240
109 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNU6-994P-201
ENST00000410507
111 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
MTND4LP30-201
ENST00000454092
297 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
RNU7-181P-201
ENST00000517234
74 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
AC107973.1-201
ENST00000530249
576 nt
TSL 4
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
AC015726.2-201
ENST00000620112
122 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
AC090971.5-201
ENST00000621102
293 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
7SK.10-201
ENST00000621414
298 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL1
Q13616
Y_RNA.813-201
ENST00000364639
102 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
Y_RNA.424-201
ENST00000384063
103 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6-102P-201
ENST00000384485
104 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD105-201
ENST00000386910
85 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6-308P-201
ENST00000390957
107 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MTCO1P5-201
ENST00000433573
344 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
AC095059.1-201
ENST00000502570
349 nt
TSL 5
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
AC126177.2-201
ENST00000552154
452 nt
TSL 3
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MIR5000-201
ENST00000577717
103 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RAC1P9-201
ENST00000604990
392 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
HECTD2-202
ENST00000371667
4354 nt
TSL 1 (best)
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORA2B-201
ENST00000384583
137 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MIR570-201
ENST00000384917
97 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6-823P-201
ENST00000391042
103 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU1-119P-201
ENST00000391122
165 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6ATAC20P-201
ENST00000408436
127 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MIR1252-201
ENST00000408861
65 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
PMCHL1-202
ENST00000423102
261 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
Y_RNA.637-201
ENST00000459424
114 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
AC090155.2-201
ENST00000518854
267 nt
TSL 3
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
AC023934.1-201
ENST00000574529
2389 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MIR4264-201
ENST00000583520
66 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
AC013791.1-201
ENST00000616619
62 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
uc_338.4-201
ENST00000616635
176 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MIR1-1-201
ENST00000362147
71 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-34-201
ENST00000362441
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNA5SP347-201
ENST00000362445
119 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-12-201
ENST00000362583
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-29-201
ENST00000362834
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-9-201
ENST00000362912
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-21-201
ENST00000362963
81 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-14-201
ENST00000363090
81 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-13-201
ENST00000363358
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-41-201
ENST00000363608
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-11-201
ENST00000363616
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6-1205P-201
ENST00000363625
106 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-5-201
ENST00000363633
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-39-201
ENST00000363694
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-4-201
ENST00000363810
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD45.3-201
ENST00000363836
72 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-16-201
ENST00000363887
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-6-201
ENST00000363942
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-42-201
ENST00000364273
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
Y_RNA.276-201
ENST00000364732
109 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-15-201
ENST00000364809
81 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-1-201
ENST00000364961
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-26-201
ENST00000365067
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-10-201
ENST00000365073
81 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
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