Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEUROD1Q13562 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NEUROD1Q13562 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms