Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBB3Q13509 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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TUBB3Q13509 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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TUBB3Q13509 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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TUBB3Q13509 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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TUBB3Q13509 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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TUBB3Q13509 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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TUBB3Q13509 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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TUBB3Q13509 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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TUBB3Q13509 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TUBB3Q13509 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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