Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MSLNQ13421 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MSLNQ13421 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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