Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MRPL49Q13405 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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