Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NME3Q13232 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NME3Q13232 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NME3Q13232 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NME3Q13232 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NME3Q13232 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NME3Q13232 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NME3Q13232 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NME3Q13232 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NME3Q13232 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NME3Q13232 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NME3Q13232 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NME3Q13232 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NME3Q13232 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NME3Q13232 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NME3Q13232 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NME3Q13232 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NME3Q13232 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NME3Q13232 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NME3Q13232 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NME3Q13232 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NME3Q13232 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NME3Q13232 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NME3Q13232 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NME3Q13232 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NME3Q13232 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NME3Q13232 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NME3Q13232 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NME3Q13232 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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