Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ACACAQ13085 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ACACAQ13085 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.5 ms