Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHD3Q12873 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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