Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms